Adam Clay har dragit sig tillbaka från uppdraget som Beekeeper - en hemlig, statlig specialgrupp som kallas in när landet är i uppenbar fara eller lagarna inte räcker till. När en vän plötsligt tar sitt liv, upptäcker Adam en konspiration i maktens absoluta toppskikt, där hänsynslösa affärsmän har satt i system att ge sig på samhällets svagaste. Ingen verkar vara intresserad av att sätta dit förövarna, men Clay tänker inte låta dem komma undan ännu en gång.